После ISPmanager меня не перестает удивлять cPanel. Казалось бы, такая мелочь, как установка индексного файла отличного от index.html, – напрочь отсутствует в cPanel.

Изменить можно только редактированием файлов вручную. Написал небольшую заметку на клиентской вики Айхора. Как сменить индексный файл для сайта в cPanel